Если вы обновляете или устанавливаете новый пакет, то если в файловой системе уже присутствуют файлы, включённые в этот пакет, то операция обновления/установки обрывается и выводятся файлы, которые уже присутствуют в системе. В моей практике причинами обычно являются пакеты, установленные с помощью pip и те же самые пакеты, которые пытаются установить с помощью pacman — в…